对第三方药物警戒公司的要求大致同于法律法规对药企的药物警戒要求。
首先，应当建立完善的药物警戒体系，设置清晰、严密的处理流程，配备符合法律要求和实践需要的人员与资源。其次，如前所述，药物警戒也会涉及个人信息保护的问题，因此需要考虑第三方公司是否具有个人信息保护的意识，内部软硬件系统是否采取了防火墙等IT技术保护措施，是否具备数据安全方面资质，是否可能涉及数据出境问题等。
此外，企业也需要注意利益冲突的可能性，尽可能要求第三方公司不与竞争公司进行合作；若确实无法避免，也应当要求第三方药物警戒公司建立完善内部防火墙制度，从而避免自身保密信息被泄露。
最后，药物警戒具有较强的时效性，受到监管部门的强监管和法律法规的严格约束，因此与第三方药物警戒公司进行合作时，有必要强调时效性，并提出更为严格的要求。企业可以在合同中对双方权利义务以及责任划分进行明确，以约束并规范第三方药物警戒公司的履行行为。必要时，也可以采取分阶段付款的方式，保证服务质量。
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